清设富州，1927年设富宁县，系因元时曾于此置过安宁州，后又将安宁州并入富州，故名。
富宁古为句町县地，西汉隶牂牁郡，蜀汉以后隶兴古郡，北周废。隋属南宁州总管府地，唐前期为僚子部，隶岭南道，后为黔中道地。宋初属邕州，皇祜五年（1053年）后为特磨道地。元至元十四年（1277年），境内置富州、安宁、罗佐三州，属广南西路宣抚司。明初，安宁、罗佐并入富州，属广南府，洪武十七年（1384年）建富州城，治所在普厅（今县城），崇祯中州治所移驻皈朝（今归朝镇驻地），仍称富州，又称土富州。清乾隆三十六年（1771年）设广南府分防普厅塘经历，驻普厅。光绪二十七年（1901年）改土归流。二十八年（1902年）州治所从皈朝移驻普厅，称富州厅抚彝府，同时改普厅塘经历为巡检，移驻剥隘（今剥隘镇驻地），仍为广南府节制。1912年改为富州县，属云南蒙自道。1937年，以古富州、安宁州各取一字组合命名富宁县，属云南省第二行政督察区。建国后，仍称富宁县，1960年属文山专署，1958年改属文山壮族苗族自治州至今。